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1、轉讓雙方之間的股權轉讓合同糾紛案件。如請求履行轉讓合同，請求支付股權轉讓款并賠償損失(或支付違約金)，或者請求解除轉讓合同，請求認定轉讓合同無效，等等。總之，這類糾紛主要適用《合同法》的相關規(guī)定進行審理，同時個案審理也要兼顧新《公司法》中的特別規(guī)定及原則。

2、涉及保護公司內部其他股東優(yōu)先購買權的訴訟糾紛案件。例如，新《公司法》第72條第2款規(guī)定，股東向股東以外的人轉讓股權時，不同意的股東應當購買該轉讓的股權，但關于購買價格如何確定，是以對外轉讓合同的價格，還是以公司凈資產(chǎn)重新進行評估確定價格，實務中爭議較大，有必要盡快統(tǒng)一認識。再如，股權轉讓合同履行完畢，因出讓股東未履行向公司其他股東的告知義務，公司其他股東主張合同無效并請求行使優(yōu)先購買權糾紛案件，對這類案件，有些法院認為應當首先審查公司章程是否有約定，公司章程有約定的，按約定處理;公司章程沒有約定時，應當考慮合理期限，在股東名冊或者工商登記作出變更超過一定期限時，其他股東主張行使優(yōu)先購買權的，可以考慮不予支持。

3、因轉讓瑕疵出資股權引起的糾紛案件。受讓方如果明知出讓方出資存在瑕疵仍受讓股權時，對未足額出資部分應承擔連帶補充責任;相反，如果受讓方對此不知情，不應承擔責任，并且也有權以此為由請求撤銷股權轉讓合同。

4、隱名、顯名股東轉讓股權引起的訴訟案件。這類案件情況比較復雜，隱名與顯名股東之間是合同關系，具有相對性。通常情況下隱名股東與顯名股東之間的約定，不能對抗公司及公司其他股東，也不能對抗第三人。

5、股權的善意取得糾紛案件。公司股權被無權轉讓后，受讓方主張善意取得公司股權。審理這類案件時，既要考慮公司法律關系具有外觀公示的特點，又要注意善意取得制度的基本原理，依法保護公司股東和善意第三人的合法權益。

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